Tổ chức thực hiện phân tích môi trường cần phải có thủ tục kiểm soát chất lượng để bảo đảm độ tin cậy của kết quả phân tích.
Tất cả các dữ liệu liên quan tới quá trình phân tích, kết quả phân tích cần phải được ghi chép, lưu giữ.
Tổ chức có thể áp dụng đồng thời nhiều biện pháp để kiểm soát chất lượng nội bộ.
Kết quả phân tích là tin cậy và được chấp nhận nếu phù hợp với tiêu chí đưa ra của tổ chức hoặc của chương trình quan trắc.
Bên cạnh đó, kiểm soát chất lượng để phát hiện nhưng vấn đề ngoài những tiêu chí đã định, đa ra kế hoạch hành động và hiệu chỉnh ngăn ngừa việc báo cáo kết quả sai.