Kể từ ngày Điều lệ Trung tâm được cấp phép theo thời hạn kiểm tra và phê chuẩn, thời hạn hoạt động của Trung tâm là 20 năm. Trong trường hợp sau khi thời hạn trên hoàn thành, những hoạt động cần tiếp tục, thì hai bên sẽ tiến hành đề nghị và khảo sát để kéo dài thêm. Trong trường hợp trước kì hạn đó, một trong hai bên muốn hủy bỏ hợp đồng thì phải thông báo cho Hội hữu nghị Việt Nhật và Hội hữu nghị Okinawa – Việt Nam trước ít nhất 6 tháng.